今回は、ファイルの入力に関するヒントを書きます。
ファイルからの入力はread.table関数
R言語では、baseパッケージの中にread.table関数、read.csv関数などがあります。これを利用すれば、簡単にテキストファイルとして保存されているデータを読み込めます。しかし、read.table関数で作成されるdata.frameオブジェクトは容量制限が結構きびしく、２０変数で１００万行あるようなデ−タだと容量ぎりぎりになります。問題は、ファイルを中までしか読んでいなくても警告しか出ないことです。そのままコードが走ってしまうので、きちんと確認しないと実はファイルがうまく読み込めていなかったということになりかねません。
data.tableパッケージの利用
そこで、data.tableパッケージを利用します。data.tableオブジェクトは、data.frameよりも大きなデータを高速に読み込むことができます。
data.tableオブジェクトに入力するにはfread関数を用います。
#data.tableパッケージの起動 library(data.table) #ファイルの読み込み dat <- fread("filename.txt", sep = "\t")
