今回は、RStudioを使っている時に出てきたエラーへの対処をメモ代わりにまとめておきます。
RマークダウンファイルからPDFファイル作成
RStudioでは、Rマークダウン形式ファイルがあり、マークダウン形式のテキスト、Rコード、出力結果、グラフを一つのファイルに出力できます。出力ファイルの形式にはHTML, PDF, Docがあります。PDFファイルに出力するためには TeXを利用する必要があり、macではMacTeXが推奨されています。
謎のGhostscriptエラー
Mac OS X(Yosemite)でRマークダウンをPDFとして出力する際にmarkdownのコンソールに奇妙なエラーメッセージが出ていることに気づきました。
!!! Error: Ghostscript exited with error code 133!
このエラーは、Rコードでplotなどグラフを生成しているときのみ現れるようです。ちなみにPDFはきちんと出力されており、特に不備があるようには見えませんでした。
対処：Ghostscriptの再インストール
２０１５年１２月現在、MacTeXのビルドは２０１５年６月のものです。このインストーラーの中にGhostscriptが含まれているのですが、バージョンは9.16です。エラーの原因についていろいろ調べてもわからないのですが、以下のページではGhostscriptの再インストールが推奨されていました。
Yosemite - MacTeX - TeX Users Group
そこで、以下のページで Ghostscriptを再インストールすることにしたのですが、よく見ると最新のビルドは9.18でした。そこで9.18をインストール。その後、PDFを出力したらエラーが出なくなりました。
